يٌشكل مجلس التخطيط على النحو الآتي:
1	رئيس المجلس	رئـيساً
2	المدير	رئيساً مناوباً
3	نائب المدير	عضواً
4	الوكيل	عضواً
5	عميد شؤون الطلاب	عضواً
6	أمين المكتبة	عضواً
7	أمين الشؤون العلمية	عضواً
8	عميد كلية الدراسات العليا	عضواً
9	عميد كلية الدراسا الاقتصادية والاجتماعية	عضواً
10	عميد مدرسة العلوم الإدارية	عضواً
11	عميد كلية القانون	عضواً
12	عميد كلية الهندسة	عضواً
13	عميد كلية الدراسات التقنية والتنموية	عضواً
14	عميد كلية العمارة	عضواً
15	عميد كلية علوم الجغرافيا والبيئة	عضواً
16	مدير معهد الدراسات والبحوث الإنمائية	عضواً
17	مدير أحد المعاهد بالجامعة يختاره المدير بالتشاور مع رئيس المجلس	عضواً
18	مدير إدارة الإستثمار	عضواً
19	أحد أعضاء هيئة التدريس ممن هم في مرتبة علمية عالية بمجمع العلوم الطبية والصحية يختاره المدير بالتشاور مع رئيس المجلس	عضواً
20	أحد أعضاء هيئة التدريس ممن هم في مرتبة علمية عالية بمجمع العلوم الزراعـــية والبيطرية يختاره المدير بالتـــشاور مع رئيس المجلس	عضواً

21	أحد أعضاء هيئة التدريس ممن هم في مرتبة علمية عالية من الدراسات الإنسانية ولتربوية يختاره المدير بالتـــشاور مع رئيس المجلس	عضواً
22	أحد أعضاء هيئة التدريس ممن هم في مرتبة علمية عالية الأساسية والهندسية يختاره المدير بالتـــشاور مع رئيس المجلس	عضواً
23	وكيل وزارة التعليم العالي والبحث العلمي	عضواً
24	وزير بوزارة المالية والاقتصاد الوطني	عضواً
25	ثلاثة أشخاص من خارج الجامعة من ذوي الاهتمام بالتخطيط والتنمية يختارهم المدير بعد التاور مع رئيس المجلس لفترة ثلاث سنوات قابلة للتجديد	عضواً
26	رئيس اتحاد طلاب جامعة الخرطوم	عضواً
27	أثنان من أعضاء المجلس (من خارج الجامعة) يختارهما رئيس المجلس بعد التشاور مع المدير مدة ثلاثة سنوات	عضواً
28	وكيل وزارة تنمية الموارد البشرية	عضواً
29	محافظ بنك السودان المركزي	عضواً
30	رئيس لجنة التعليم بالمجلس الوطني	عضواً
31	وكيل وزارة التعليم العام	عضواً
32	مدير إدارة التخطيط	عضواً ومقرراً